Wie kann es sein, dass die beiden Google-Werkzeuge Analytics und Webmaster Tools unterschiedliche Daten anzeigen? Genau diese Frage wurde Matt Cutts nun gestellt. Im folgenden Video erklärt Matt Cutts, warum die Daten unterschiedlich sind und warum Webseitenbetreiber sich darüber keine Sorgen machen sollten:

Why doesn’t the clickthrough data in Webmaster Tools match what I see in Google Analytics? (2:13)

Zusammenfassung: Einleitend erklärt Matt, dass das Webmaster Tools-Team und das Analytics-Team nicht auf den gleichen Datenpool zurückgreifen und untereinander auch keine Daten austauschen (können). Verschiedene Werte bei GWT / Analytics resultieren vor allem aus der unterschiedlichen Datenerhebung: GWT-Daten werden serverseitig direkt von Google erhoben, Analytics setzt hingegen auf JavaScript. Wenn User JavaScript deaktiviert haben oder einen Browser ohne JS-Unterstützung nutzen, werden keine Daten dieser User erfasst.